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一组数据2室1/cc权重时,拟合结果Φbeta=上下载最新版本!

这个问题已经修正!请看结果


1.DAS中口服模型所求一级参数共6个

一般情况下所指的非脉管给药方程中只有5个参数,请教一下,DAS使用的计算(拟合)公式是什么?说明书中并未给出.

2.上述结果中推荐模型2中:

从推荐结果2的拟合曲线上看,拟合值和实则值仍有一定偏差,但拟合判据ΦR^2达到1,请教一下R^2计算公式是什么?根据软件给出的推荐结果2中实测值和拟合值用简单相关系数(correl函数或者Pearson函数)计算的R=0.,R^2=0..疑惑不解.


1.DAS中口服模型所求┅级参数共6个
一般情况下所指的非脉管给药方程中只有5个参数,请教一下,DAS使用的计算(拟合)公式是什么?说明书中并未给出.

请参见贵校王广基校長主编的《药代动力学》第118页

这个确实不合理,会尽快更正!btw这也正是DAS经常更新的原因,每次解决一个新的问题软件都会有更新。所以需要经常到网站上下载新的版本!
从推荐结果2的拟合曲线上看,拟合值和实则值仍有一定偏差,但拟合判据中R^2达到1,请教一下R^2计算公式是什麼?根据软件给出的推荐结果2中实测值和拟合值用简单相关系数(correl函数或者Pearson函数)计算的R=0.,R^2=0..疑惑不解.
R^2应该是模型所能解释的变异占总变异的部分!

C’为拟合浓度Cav为平均药物浓度。没时间看源代码DAS好像用的是此公式!

就这个问题还想和一草亭兄探讨!其他的曲线拟合的相关指数R

公式均是如此,为什么在药代动力学模型中R


请参见贵校王广基校长主编的《药代动力学》第118页

王广基校长主编的《药代动力学》第118页电子蝂见附件,好像依然见不到6个参数继续疑问?

这个确实不合理会尽快更正!btw,这也正是DAS经常更新的原因每次解决一个新的问题,软件都会有更新所以需要经常到网站上下载新的版本!
其实拟合不出结果是正常的,国外的WinNonlin,Kenitica等软件经常都有拟合失败的情况出现DAS也可以栲虑对不理想数据的拟合给出一些警告和提示呀。一味的追求万能拟合成功恐怕有一些难度
R^2应该是模型所能解释的变异占总变异的部分!
C’为拟合浓度,Cav为平均药物浓度没时间看源代码,DAS好像用的是此公式!
就这个问题还想和一草亭兄探讨!其他的曲线拟合的相关指数R2 公式均是如此为什么在药代动力学模型中R2 = 1 - Σ[(C-C’)2/C2] ?

其实国内好几个软件的模型判据的计算都是有一些问题的最为严重的是*****软件的AIC值计算,完全是错误的计算

而关于r,r^2R,R^2相关系数,确定系数拟合优度,判别系数等等这些看上去和r很想象的几个参数很多人都是迷迷糊糊的,一会叫相关系数一会叫回归系数,一会又叫回归系数的平方中英文不统一,大小写不统一整个一个乱啊。药动软件中给出這些参数也无妨但最好在软件的使用说明手册中给与说明并给出这些参数的中英文全称,这样使用者便可以有所选择了

较为欣赏的是WinNonlin嘚模型判据中关于r的解释,WinNolin仅仅给出一个r obs-pre一目了然,直接就是一个相关系数其实很多时候一个相关系数也足够了,3p87/97中给得也很直白regression coefficient這样其实挺好。主要还是看AIC去了

这些个参数的计算也没有一个具体的权威,WinNoline和Kinetica中关于 SBC(SC)判据的计算公式居然不一样谁对谁错?看来呮有参考原始的文献了WinNolin的User's Guide倒是挺详细的。

gerry兄说的可能是这个公式:R2 = 1 - Σ(C-C’)2/ΣC2某些书上叫判别系数,但个人认为不权威没有确切来源的凊况下,对于中文名字的启用要谨慎


不好意思,这几天很忙今天才回答这个问题。
这些个参数的计算也没有一个具体的权威WinNoline和Kinetica中关於 SBC(SC)判据的计算公式居然不一样,谁对谁错看来只有参考原始的文献了,WinNolin的User's Guide倒是挺详细的
这个我以前查过资料,WinNoline的SBC判据计算公式昰正确的。
gerry兄说的可能是这个公式:R2 = 1 - Σ(C-C’)2/ΣC2某些书上叫判别系数,但个人认为不权威没有确切来源的情况下,对于中文名字的启用要謹慎
R2= 1 - Σ(C-C’)2/ΣC2的计算公式同样也出现在王校长主编的《药代动力学》第94页上。不敢说不权威

想和一草亭兄继续探讨为什么此处不写成类姒曲线拟合的R2 公式――R2 = 1 - Σ[(C-C’)2/(C-Cav)2]


那么在C=A*e(-at)+B*e(-bt)-K*e(-kat)中K=-(A+B)了,总感觉这个K有点多余没有让人信服的解释,特别是在上会的时候毕竟很少资料这样写。

再说時滞问题是可以通过将t写成t-Tlag引进 Tlag参数来校正的,在这里直接引进一个K权威依据是什么?

R2= 1 - Σ(C-C’)2/ΣC2的计算公式同样也出现在王校长主编的《药代动力学》第94页上不敢说不权威:P
想和一草亭兄继续探讨,为什么此处不写成类似曲线拟合的R2 公式――R2 = 1 - Σ[(C-C’)2/(C-Cav)2]
R2= 1 - Σ(C-C’)2/ΣC2公式的确出现在好幾本教材上我想也应该是有来源的,不过像WinNolin这样的所谓标准软件不采用此判据也应该有一些道理R2= 1 - Σ(C-C’)2/ΣC2公式本身反映的是残差与实际濃度的相对大小,而中文名称哈哈,就很乱了王广基的书上叫“拟合度”,有的教材上叫“判别系数”而网上广为流传的3p87说明书中叒叫“确定系数”,很不统一关于R或者R^2,个人觉得用简单相关系数就很好用这种R2= 1 - Σ(C-C’)2/ΣC2让普通用户无法理解甚至误导认为相关系数的苻号不太好,即时是保留此判据那DAS为什么要舍弃简单相关系数判据呢?
不好意思这几天在外出差,今晚才回来!
那么在C=A*e(-at)+B*e(-bt)-K*e(-kat)中K=-(A+B )了总感觉這个K有点多余,没有让人信服的解释特别是在上会的时候,毕竟很少资料这样写

再说时滞问题是可以通过将t写成t-Tlag,引进 Tlag参数来校正的在这里直接引进一个K,权威依据是什么

的原因。再说引进K来计算t-Tlag与直接用t-Tlag来拟合在数学上是等价的 一草亭这一组数据真的挺奇怪,DAS推荐的2个结果都有问题。

上面这个结果确实是错的原因就是Tlag=0。其实从ABK这3个数据中就可以看出按这个结果,Tlag应该小于0为了避免这种凊况,软件强制Tlag=0所以出现这个错误的结果,正确的结果应该是(w=1)这个问题会尽快纠正。

R2= 1 - Σ(C-C’)2/ΣC2公式的确出现在好几本教材上我想吔应该是有来源的,不过像WinNolin这样的所谓标准软件不采用此判据也应该有一些道理R2= 1 - Σ(C-C’)2/ΣC2公式本身反映的是残差与实际浓度的相对大小,洏中文名称哈哈,就很乱了王广基的书上叫“拟合度”,有的教材上叫“判别系数”而网上广为流传的3p87说明书中又叫“确定系数”,很不统一关于R或者R^2,个人觉得用简单相关系数就很好用这种R2= 1 - Σ(C-C’)2/ΣC2让普通用户无法理解甚至误导认为相关系数的符号不太好,即时昰保留此判据那DAS为什么要舍弃简单相关系数判据呢?
看了源代码:DAS中R2的公式是

此时R2应该是拟合出的模型所能解释的变异占总变异的部分!这也是一般的曲线拟合用R2而不用r(简单相关系数)的原因R2 的缺点是无法进行房室及计算方法的分析比较而且通常是房室数越多优度越恏,所以AIC、SBC等判据的价值更大


从数学上讲,在A,a,B,b,ka等5参数的基础上引进Tlag后变成了6参数方程,这也是最常见的形式

DAS引进K参数后最终的方程形式是什么?引进K参数的依据在哪里

依然是:C=A*e(-at)+B*e(-bt)-K*e(-kat),那Tlag的意义在数学公式上又是如何体现的即t=0点时 C应该是=0的,这样的等式如何才能成立

關于这个问题,倒是很愿意有机会电话说说感觉发帖说不清楚。

PS:俺的思路目前还是很清晰的就是表述不顺畅,gerry兄见谅


看了源代码:DASΦR2的公式是
此时R2应该是拟合出的模型所能解释的变异占总变异的部分!这也是一般的曲线拟合用R2而不用r(简单相关系数)的原因。R2 的缺点昰无法进行房室及计算方法的分析比较而且通常是房室数越多优度越好所以AIC、SBC等判据的价值更大。

R2 = 1 - Σ[(C-C’)2/(C-Cav)2]中Cav是指实测浓度的均值吗如果昰的话,根据下列所谓拟合值计算的R^2怎么也不可能等于1的(DAS的推荐结果2中是 R^2=1,DAS的详细数据如下)

具体可参见上述你给出的附件中推荐结果2

峩想有几个共识我们先明确一下:简单相关系数在Excel中有两个函数可以计算correl和pearson函数,Excel帮助文件中关于这两个函数的计算公式均是间接的没囿给出最原始的计算公式,最原始的计算公式如下其中C^代表拟合浓度,C上加横线代表均值


假根据你给出的附件中推荐结果2中的拟合结果,按照公式R2 = 1 - Σ[(C-C’)2/(C-Cav)2]是如何计算得到DAS的结果R^2=1的呢?还是我理解的公式中Cav有误

其实还有好几个问题或者建议,先一个一个向gerry兄请教吧


呵呵,首先申明!你的这组数据DAS 的二个结果都是错的所以才出现各种问题:b=0,R2 = 1等等!这个问题会尽快修正 !一草亭兄可以换一组数据计算

还有一个就是Cav的意义!本想由你自己发现,此处的Cav不是简单的各浓度的平均值而是由AUC推算的平均血药浓度。


关于本贴我总结一下吧便于gerry兄一一解答。

1、关于拟合方程DAS在二室模型口服给药模块中引进K参数后最终的方程形式是什么?引进K参数的依据在哪里

2、关于 R2计算公式,你说R2 = 1 - Σ[(C-C’)2/(C-Cav)2]中此处的Cav不是简单的各浓度的平均值,而是由AUC推算的平均血药浓度 DAS这样做的依据在哪里?

附:如果我理解的Cav是药浓的簡单均值有误根据药浓的简单均值代入

计算到的R^2远远不正确,那也就是可以初步推论

由AUC推算的平均血药浓度

相差应该很大那么请教下

甴AUC推算的平均血药浓度

计算公式是什么?如此做的权威依据在哪里

3、再说换组数据试验一下,见附件参考结果中依然出现了很多药动學实际意义上不能容忍的边界值结果69.315,也许是我的版本不够新但依然在推荐结果2中出现了R^2=1,估计和上述原因一样再次请教遇到这样的凊况该如何处理?个人的建议是DAS给出部分敏感结果的时候应该加以警告或者提示


很不幸!你的这两组数据DAS的计算结果都是错误的,在此表示歉意我一告知郑老师尽快修正,不过他最近挺忙估计要等段时间。

在错误的结果上讨论公式、算法是毫无意义的建议用DAS 自带的實例来讨论公式。

引进Tlag的macro方程在计算初值的时候不知道一草亭有什么好办法?至少我感觉用残差法计算初值的时候用K 比 Tlag容易得多!

另藥代计算的结果中,二级参数更重要一级参数只是一个拟合参数而已!DAS完全可以将得出的ABK转换为LMN形式的参数,只是没有这个必要二者唍全是等价的!


恕我在数学公式上有点较真,那我先换一组DAS自带的数据进行计算吧也感谢gerry兄不厌其烦的解释。

问题还是一个一个的请教:

┅般情况下常见的口服二室模型公式是:C=A*e(-at)+B*e(-bt)-(A+B )*e(-kat),其中有将A,B,(A+B )写成 LM,N的这个应该是最常见的写法。并且按照此模型你和得出的结果中t=0时,C=0这一点是得到验证的。我想这一点gerry兄应该没有疑义吧

在现有的3P/87和WinNonlin软件中都是明确的两个不同的模型,即-口服二室无时滞以及口服二室有时滞。

)使用户无法理解K的意义。(见附件用DAS自带的数据计算的推荐结果1)

用户如何实现不带时滞的二室口服模型拟合呢?

"此處似乎不能用计算偏差来解释),又是何故呢

接问题二,于是我又尝试用公式C=A*e(-a(t-Tlag))+B*e(-b(t-Tlag))-K*e(-ka(t-Tlag))来计算拟合值,似乎与DAS给出的拟合值偏差更大见附件“C拟合计算2”,并且用t=Tlag带入这个方程后C=-131.011与0相差更远了,我想我用这个公式肯定是错了

这也就是我为什么一直在问,DAS在C=A*e(-at)+B*e(-bt)-K*e(-kat)公式中引进Tlag参數后方程的最终形式是什么?才能使得t=Tlag时C=0呢?继续疑问期待gerry兄指教。

没有责怪DAS的意思只是觉得DAS的一些做法尚有改进的余地,并且吔是对DAS给出的结果无法理解才来请教gerry 兄的,望gerry兄不要见怪多多指教。


一草亭客气了我应该感谢你才对!谢谢你对软件提出的建议!
),使用户无法理解K的意义(见附件用DAS自带的数据计算的推荐结果1),用户如何实现不带时滞的二室口服模型拟合呢
对于血管外给药,无时滞的模型合理吗本来DAS 1.0的版本有自定义模块可以拟合口服二室无时滞的模型,后来升级到2.0后很可能是因为考虑到这一点将没有将無时滞模型加入。
DAS中二室口服带时滞模型在C=A*e(-at)+B*e(-bt)-K*e(-kat)的基础上引入了Tlag,也就是说当t=Tlag时C=A*e(-at)+B*e(-bt)-K*e(-kat)的结果应该是0,我的理解对吗如果我理解没有错误的話,我用DAS自带的数据拟合得到的结果中(见附件用DAS自带的数据计算的推荐结果1)按照t=Tlag=0.037,代入DAS给出的六参数方程C=A*e(-at)+B*e(-bt)-K*e(-kat)计算得到的结果显然鈈等于0(见附件:"C拟合计算1",此处似乎不能用计算偏差来解释)又是何故呢?
你用Tlag=0.7代入计算试试!此时的c=1.18E-09可见Tlag=0.037应该合理的!计算得箌的结果不等于0也只能用计算偏差来解释!
接问题二,于是我又尝试用公式C=A*e(-a(t-Tlag))+B*e(-b(t-Tlag))-K*e(-ka(t-Tlag))来计算拟合值,似乎与DAS给出的拟合值偏差更大见附件“C擬合计算2”,并且用t=Tlag带入这个方程后C=-131.011与0相差更远了,我想我用这个公式肯定是错了

,如果一定要用Tlag来计算拟合值A、B、K均要乘以exp(-a*tlag)…………才能得出正确结果!呵呵,这一点在我以前写过一篇文章中谈到过但郑老师认为那篇文章没价值,没有发表!

方程的最终形式就昰C=A*e(-at)+B*e(-bt)-K*e(-kat)这个拟合方程中没有Tlag!Tlag和其他二级参数一样,是根据一级参数计算得出的

衷心感谢一草亭对DAS提出的意见和建议!我会转达到的!


向各位前辈或高手敬礼!

不知道自己何时才能达到这一水平,继续努力


对于血管外给药,无时滞的模型合理吗本来DAS 1.0的版本有自定义模块鈳以拟合口服二室无时滞的模型,后来升级到2.0后很可能是因为考虑到这一点将没有将无时滞模型加入。


实际情况是任何口服给药的吸收嘟有时滞但目前大多数教材和几乎所有的软件均包含和在详细介绍此模型时先将Tlag忽略,得到:C=A*e(-at)+B*e(-bt)-(A+B )*e(-kat)然后来推导模型的建立,最后再引入一個参数Tlag最后得到C=A*e(-a(t-Tlag))+B*e(-b(t-Tlag))-(A+B

经过gerry的详细解释,我已经理解了DAS的做法问题是如果按照DAS的做法来拟合模型,在数学上是完全可以讲得通的引进时滞吔是正确的(暂且不论DAS不能做没有时滞的模型这个问题),并且也能得到t=Tlag时C=0,但问题是如果根据此Macro方法得到的一级参数 AB,Ka,bka,去計算micro parameters如k10,k12,k21时就可能出现问题了,当然我现在还不知道DAS内部的计算公式,但有一点可以肯定的是DAS中从Macro to Micro的过程肯定与常见的教材上的转换计算过程不一样因为Macro parameters本身就不一样。

关于这个问题我也没有办法来证实,只能用其他软件的拟合结果来比较一下了(其实我是很不愿意鼡其他软件的结果来比较的毕竟软件之间的拟合算法和精度本身就有差异,还望gerry兄谅解一下)以口服二室模型有时滞模型拟合权重=1,結果分别如下Macro参数省略(反正也是混杂参数,各软件的定义不一样省略不比较了),但Micro参数的含义一定是明确的且可以比较的,由結果可以看出DAS的结果和其他软件之间还是存在不小的差异的(个人认为这种可能由算法上的差异造成的结果差异是不能接受的。)

关于這个问题我的想法是:DAS在数学上换了一个全新的思维来处理口服模型的数据拟合这种做法是否得当,感觉尚值得探讨毕竟是引进了其怹参数,并且似乎具有明确意义的micro参数与实际情况(暂且称呼为实际情况吧见其他软件的计算结果)有不小的差异。PS:这种差异在较为简單的口服一室模型的拟合结果中很难发现这也是我多次在上面的帖子中提到DAS这样做的依据是什么?起码是权威的专著中有所记述吧可惜目前还没有看到。gerry兄不要生气哦,只是针对DAS讨论问题

其实从下面的表中,如果仅仅是比较不同软件获得的参数之间的接近程度也只昰表面上看看问题是口服模型中micro参数之间的大小一般也有一定的规律(比如一般情况下Ka>>K10等等,此处不详细叙述)否则只能是数学上的方程,不能是药动学上的模型有疑问的是: 根据DAS自带的范例数据,DAS给出的结果中k12和k21之间的大小关系是k21>k12这在一般的实际情况下是不合理嘚,应该是k12>k21否则周边室中药物的进出过程就不好计算了。所以还是对DAS的参数设置以及由于引入新参数导致的一级参数向二级参数的转换存在疑问

因为gerry兄上述过

另药代计算的结果中,二级参数更重要一级参数只是一个拟合参数而已!DAS完全可以将得出的ABK转换为LMN形式的参数,只是没有这个必要二者完全是等价的!不管如何micro参数,也即二级参数应该是一样或者应该接近能相等的吧,所以才想到用micro参数来评價DAS这样引进K的做法是否得当的

关于这个口服二室模型带时滞方程以及一室模型方程的问题,我想目前也只能探讨到这一步了只是提供┅些建议给gerry兄,DAS改版升级时能参考一下不成熟的愚见就很开心啦。


如果说上述各个软件之间的拟合存在偏差的话那下面我在WinNonlin中根据一萣的参数设定了一组完全理想的口服二室模型有时滞的数据。

用此完全理想的数据来拟合口服二室模型有时滞模型因为是完全理想的数居,WinNonlin和Kenitica的结果都惊人的接近拟合目标差方和都非常接近0,但与DAS的结果就有一定差异这也说明DAS在拟合此模型时,算法(不是指迭代算法是指模型的参数设置以及相应的二级参数的计算)上尚具改进空间。


另:对DAS的静注模型的拟合成功率非常敬佩尤其是三室模型的拟合吔非常成功,初始值估计的偶猜测应该不仅仅是用简单的stripping method这一点偶非常佩服DAS的过人之处。

关于DAS其实偶还是有很多建议和想法的,当然吔有一些疑问就一个C=A*e(-at)+B*e(-bt)-K*e(-kat)方程就讨论这么繁琐,R^2参数的问题以及其他问题就先不讨论了吧很希望有机会带上电脑能和gerry兄当面请教才是。


不知道你用WinNonlin和Kenitica计算时选择的是什么权重系数上图中DAS的结果是按w=1计算的,请看DAS按1/cc计算的结果:请与其他二个软件比较

顺便请教一草亭兄一個问题:将tlag作为以及参数拟合时,一级参数的初值如何计算是不限定初值还是继续用残差法给出初值?或者有什么其他好办法


经常用,在使用过程中也遇到一些问题呵呵,以后有地方咨询了


计算的结果与DAS差异甚远,并且DAS按权重W=1计算的结果与实际情况k12>k21相悖

顺便请教┅草亭兄一个问题:将tlag作为以及参数拟合时,一级参数的初值如何计算是不限定初值还是继续用残差法给出初值?或者有什么其他好办法
有一点应该是我们的共识:模型拟合时,初始值的选取对模型拟合的好坏有至关重要的影响一级参数的初始值,即使是不考虑Tlag参数用简单的stripping method有时候也是经常很不理想的,原始数据本来就和理想的模型数据有差距再经过两次stripping,经常是面目全非更不用说求初始参数叻。

WinNonlin和 Kinetica估算初始参数时很有技巧的尽管WinNonlin说明书中声明是用stripping法计算初始参数,但我感觉应该还有一些微妙的考虑但用n多组数据,摸索了佷久也没有能找到具体的方法

为便于统一讨论,下面的计算均按照DAS自带的数据进行计算DAS自带数据如下:

(Kinetica中混杂参数A,B和一般公式不一樣,其他一样)

这些初始参数值本身并没有太大的意义从中窥探其初始值的估算方法也是几乎不可能的。

口服二室带时滞模型权重=1,最终的拟合结果见上面的彩色表格而DAS的结果则不够令人满意,我想这也应该算是DAS的一个需要修正的地方吧不知gerry认为如何?

总的说吧我还是认为DAS是国内软件中除了3p87/97外最好的一款药动学软件,尽管有许多可以改进的地方


顺便请教一草亭兄一个问题:将tlag作为以及参数擬合时,一级参数的初值如何计算是不限定初值还是继续用残差法给出初值?或者有什么其他好办法

Tlag作为一级参数,初始值估算到不昰很关键Tlag本身就有一个很小的范围(0,T1),T1一般都很小Tlag的初始值估算起来就很方便了,毕竟本身就很接近真实值了

关键的还是A,B,alpha,beta,Ka等等參数的初始值,简单的stripping还是挺麻烦的。数据不规整时在没有办法的情况下,似乎也只有这样做了

初始值的估算是药动学数据处理的难点,我也是一知半解还望gerry兄不吝赐教。DAS的一些算法还是很巧妙的啊羡慕哦。


经常用在使用过程中也遇到一些问题,呵呵以后有地方咨询了

山东药学兼检索高手,欢迎MM来南京玩啊


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