PubMed数据库
资源名称: PubMed
创建机构:美国国家医学图书馆（NLM）的全国生物技术信息中心（NCBI）
资源地址:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/
文献类型:图书、期刊
载体类型:网络版文摘、全文数据库
揭示层次:文摘、全文
学科领域:生物医学
获取途径:直接登录网站访问PubMed.
　　PubMed提供免费MEDLINE等数据库检索，并提供部分付费全文链接服务。资源描述
PubMed是由位于美国国家医学图书馆的国家生物技术信息中心（NCBI）开发的基于Web的检索系统，建立在NCBI平台上，是一个生命科学文献书目信息数据库，也是NCBI的巨大检索系统的一部分。主要提供基于Web的MEDLINE数据库检索服务。PubMed包含了光盘版MEDLINE尚未收录的一些最新文献信息，更新速度要比光盘版快得多。
　　1．PubMed提供检索的数据库
　　（1）提供免费的MEDLINE、PREMEDLINE（将进入MEDLINE的文献预先做成一个每天更新的数据库）与其他相关数据库接入服务；
　　（2）提供到出版商站点的全文文献链接，同时也提供到第三方网站如其他图书馆和测序中心（sequencing
centers）的链接；
　　（3）通过PubMed可以访问由NCBI维护的完整的分子生物学数据库。
　　2．PubMed提供的服务（以下服务均可从PubMed的工具栏进入）：
　　（1）Journals Database：进入Journals
Database，可利用刊名、MEDLINE刊名缩写、NLM
ID号、ISO缩写或ISSN检索到期刊的出版信息；并提供链接全文网站的期刊列表“list
of journals with links to full-text web sites”。
　　（2）MeSH浏览：利用此功能在检索栏中输入要查询的词汇，可以浏览PubMed中使用的控制词汇。
　　（3）检索特定文献（Single Citation
Matcher）：从PubMed工具栏进行访问，可检索到特定刊名、卷期、作者等的文献。
　　（4）批次检索文献（Batch Citation
Matcher）：以指令式的方式检索数据库中共有几篇相关文献。输入查询格式如下：
Journal_Title|year|volume|first_page|AuthorName|Your_key|
　　（5）临床病理资料（Clinical
Queries）：提供临床病理资料的查询，提供Sensitivity（检出相关文献）和Specificity（检出密切相关文献）两种检索方式。
　　（6）LinkOut：提供与PubMed相关的大量网上资源的链接，包括全文出版物、生物数据库、消费者健康资讯、研究工具等。
　　（7）个性化检索服务（Cubby）：包括存储/删除检索结果、All
LinkOut Providers及Providers Categories、My LinkOut
References和文献传递服务等。此外，在PubMed的网站上还提供相关的服务与资源。包括：订购文献、NLM
Gateway、TOXNET（病毒学、危险化学及相关领域数据库群，属于NLM）、Consumer
Health、Clinical Alerts、PubMed Central免费电子全文等。
　　用户可通过网络免费访问PubMed。PubMed的检索方式有以下几种：主题检索、著者检索、刊名检索、布尔逻辑检索、截词检索、日期或日期范围检索、检索带文摘的记录（检索格式为检索词
AND has abstract或选中在Limits中的“only items with
abstracts”）、检索期刊子集（辑）（检索的格式为：检索词AND
jsubseta,如：neoplasm AND jsubseta）等。
　　在Journals Database检索界面下方，点击“list of journals with
links to full-text web
sites”，可通过字顺浏览期刊，并链接到相关数据库阅读文摘。
PubMed可用6种不同的格式显示检索结果，默认为Summary格式。利用PubMed的特征栏（Feature
Bar）可以对检索结果进行限定。特征栏包括条件限定（Limits）、预览/索引（Preview/Index）、检索史（History）和粘贴板（Clipboard）等4种功能。有关检索方法和技巧在PubMed网站上的Tutorial栏里有具体介绍和演示。
　　 （一）数据来源
1 MEDLINE (1966~至今)
2 PreMEDLINE
3 Publisher supplied citations
4 Oldmedline()
　　收录了全世界70多个国家和地区1966年以来的4600余种生物医学期刊，目前文摘条目;万篇，年报道量近40万条，英文刊物占90%、3/4有英文摘要，每周更新。
　　内容涉及：医学、药学、牙医学、护理学、卫生保健、兽医学等专业。
记录标注[PubMed - indexed for MEDLINE]
PreMEDLINE
　　临时性医学文献数据库，每天接收新数据，经MeSH词表标引后，每周向medline移加一次。
记录标注[PubMed - in process]
Publisher Supplied Citation
　　出版商直接向PubMed递送的电子文献。其中有一部分在Medline中未收录。
记录标注[PubMed - as supplied by publisher]
字段标识符（54个）
AB-Abstract LA-Language
AD-Affiliation MH-MeSH Terms
AU-Authors PMID-PubMed Unique Identifier
CY-Country PT-Publication Type
DP-Publication Date l SO-Source
EDAT-Entrez Date TA-Journal Title Abbreviation
GS-GeneSymbo TI-Title
IS-ISSN UID-Unique Identifiers
格式： 检索词[字段标识符]
smith jc[au]
lancet[ta]
gene therapy[ti]
　　 (二)PubMed的特点
　　一、能获取到当月、甚至当日发表的最新文献、以及1966年以前的文献。
　　二、具有强大的词语自动匹配转换功能，能对意义相同或相近的词或词组进行全面搜索，并自动转换后再检索。
　　三、把相关的期刊文献、数据、事实、图书连接在一起，形成相互贯通的信息链，方便进行追溯性检索。
　　 四、能在线获取部分免费电子版全文。
　　 二、检索规则
　　 （一）Automatic Term
Mapping词汇自动转换
　　 1、 MeSH Translation table
Vitamin c 转换为
“ascorbic acid”[Mesh Terms] OR vitamin c[Text Word]
想要查验检索词的转换情况，并进行调整和保存检索策略，可点击“details”按钮
　　 2、Journals Translation table
New England journal of medicine 转换为
“N Engl J Med”[Journal]
　　 三种不同表达方式
刊名全称、MEDLINE刊名缩写格式、ISSN
　　 3、Phrase List
Cold compresses
在前两个表中均未找到，而在短语列表中找到这个词
　　 4、Author Index
姓前（全称）、名后（首字母缩写）smith jc
　　当一个短语在前三个表中都找不到匹配词，并且有1或2个字母在词后时，PubMed就会到作者索引中查找。
　　如果在上述4个表或索引中仍找不到相匹配的词时，PubMed就将短语劈开，用AND
将短语中的单个词连接起来在全部字段中查找，直到找到相应的词为止。
　　 例：pressure point转换为((“pressure”[MeSH Terms] OR
pressure[Text Word]) AND point[All Fields])
（二）短语检索
如果在短语上加双引号，系统将只在 Phrase
List中查找，不再进行转换。
例如： “single cell”
“oxygen free radicals”
（三）布尔逻辑运算：
　　 AND、OR、NOT必须大写。
lung AND vitamin c OR ascorbic acid；
Lead poising NOT children
运算优先级为（）& NOT & AND & OR。
例如：drug therapy AND （asthma OR hay fever）
布尔逻辑检索允许在检索词后面附加字段标识
例如：dna[mh] AND crick[au] AND 1993[dp]
查带文摘的文献（1975年以后出版的文章）
检索词 AND hasabstract
例如，Neoplasms AND hasabstract
（四）截词检索：*
例：输入infect*，可检出infection、infectious,infective,infectivity,infector等
截词检索只限于单词，对词组无效，
　　 三、检索途径与方法
基本检索 - Basic Search
高级检索 - Advanced Search
(preview/index)
限定检索 - Limits Search
期刊检索 – Journal Databases
主题词检索 - MeSH Databases
引文匹配 - Citation Matcher
临床查询 – Clinical Queries
基 本 检 索
检索步骤：输入检索词，点[Go]按钮或按回车
检索词的输入形式：
输入单词或短语或表达式，也可用*及“ ”
如，aspirin；stomach ulcer
Iddm AND apoptosis
asthma Kamada A 或asthma,Kamada A
著者姓名：weng xz、 “ weng xz ”[au]
刊名标题：刊名全称、缩写、ISSN
Journal of leukocyte biology、J leukoc biol、
刊名后附加字段标识符
刊名与主题词相同的期刊
gene therapy[ta]、science[ta]、cell[ta]
单个词刊名的期刊,Scanning[ta]
带括号刊名的期刊，录入时应将括号省略
J Hand Surg[Am]输入格式为J Hand Surg Am
高 级 检 索
检索“阿尔茨海默病的基因治疗”
检索步骤：
在Search for框中输入alzheimer
disease，点击特征栏的[Previed/Index]按钮
在“All Fields”选择一个检索字段，其右侧输入框中输入检索词gene
therapy，点击[AND]，点击屏幕上部[Preview]开始检索并显示记录条数，这样可以反复操作；若点击[Go]则显示结果。
如果选择了一个检索字段，在提问框中输入检索词，点击[Index]，则系统显示相应字段的索引词列表。选中一个索引词，点击逻辑符（AND、OR、NOT），被选中的索引词会自动粘贴在提问框中，然后点击“Preview”或“Go”按钮
备注：在高级检索界面，可以用逻辑组配符将检索历史中的序号加以组配。
例，#1 AND english
限 定 检 索
检索“近2年有关细胞凋亡的综述文献”
检索步骤：
在特征栏点击“Limits”键
输入检索词apoptosis
在Limited to栏下,进行如下各种限定：
选择字段、只检带文摘的记录、文献类型（选择review）、语种、子集、年龄组、人体或动物实验、性别、录入系统日期（2
years）、文献出版日期
点击“Go”
期 刊 检 索
期刊编目信息浏览页
检索步骤：
有两种方法检索
基本检索状态下，输入刊名
高级检索状态下，在All
Fields中选择Journal字段，然后输入刊名
期刊数据库Journals Database
输入格式：刊名全称、ISSN、刊名缩写（MEDLINE、ISO）、NLM
 A List of Journals with Links to full-text Web
Sites列出与PubMed有全文链接的刊名，按字顺排列。
主 题 词 检 索
主 题 词 检 索
结果输出格式的选择
检索“阿司匹林引起胃溃疡的文献”
检索步骤：
点击“Mesh Browser”，进入MeSH浏览器的首页
在提问框中输入aspirin，点击[Go]按钮，显示该主题词的定义及其在词表中的位置。
点击[Detailed Display]键
可做如下3种选择：
选择副主题词adverse effects；
 Restrict Search to Major Topic headings
 Do Not Explode this term
浏览树形结构
选择AND（OR或NOT）、点击[Add]按钮
输入第二个检索词stomach ulcer,点击[Go]
点击[Detailed Display]，选/SH为chemical induced
选择逻辑符AND，点击[Add]键
点击[PubMed Search]按钮
备注：如果键入的词不规范，MeSH浏览器将提示该词不是主题词，并显示与之相对应的MeSH词。
引 文 匹 配
检索步骤：
点击页面左边的“Single Citation Matcher”
按界面提示分别填入所知信息
点击[Search]按钮，可得到相应的特定文献信息。
临 床 查 询
是专为临床医生设置的
可以检索某一临床主题领域的治疗、诊断、疾病和预后4个方面内容的文献，同时还可选择强调查全率或是查准率
也可以检索该主题词领域的系统性综述、元分析等类型文献。
PubMed Central
　　 四、检索结果
　　 1、结果的显示
显示每屏记录条数
Show：默认20（5-500）
page: 1 of 13 Next
显示特定记录
Display：显示所有记录
记录前方框：显示标记记录
著者名：该条记录
显示格式选择
Display旁的下拉菜单，选择记录格式：
summary默认、brief、Abstract、Citation、ASN.1、MEDLINE、XML等格式
纯文本格式 Sent to-Text
　　 2、排序
无序（Sort）
著者（Author）
刊名（Journal）
出版日期（Pub Date）
　　 3、打印或存盘
打印：使用浏览器的打印功能，
存盘：点Send to下拉按钮选file
首先选择所要存盘的数据（show），其次点击display显示所要存盘的格式，然后点Send
to-file即可
　　 4、订购全文
Send to-Order
备注：想要集中打印、存盘或订购全文时，首先点击Send
to下拉按钮，选择Clipboard，将每次检索结果保存，然后再点击特征栏上的Clipboard即可。
　　 五、链接功能
Related Articles - 链接相关文献
Links - 链接NCBI其它数据库
Necleotide、Protein、Genome、Structure、Popset、Taxonomy、OMIM、Books、Probeset、3D
Books - 链接相关图书
Linkout –
链接外部资源，与生物医学文献出版商Web站点期刊全文的链接
　　 六、特征栏（Feature Bar）
preview/index
用MeSH Database 检索主要论述“心间隔缺损的诊断（heart septal
defects；diagnosis）”的文献，要求对其下位概念词进行扩展检索。
用MeSH Database 检索主要论述“微量元素铜、铁、锌与肝癌（trace
liver cancer）”的文献。
用Journal Database查找Takuji Tanaka 发表在Cancer Sci. 2003 N 94
(11): 965-73上的文献，并获取免费全文。
用Limits界面，查找2000年以来“G6PD基因（gene）与新生儿黄疸(Neonatal
Jaundice)”的综述（review）文献（限带文摘的英文文献）。
用Preview/index界面，查找2000年以来发表的有关“TGF-β或hTERT或IL-18与肺癌（lung
cancer）”的实验研究文献。
MEDLINE——PubMed的检索方法
　　近年来，随着INTERNET的普及，一些机构通过INTERNET提供MEDLINE数据库免费检索服务，其中PubMed数据更新快，检索系统比较完善，深受广大医务工作者和图书情报人员的欢迎。本文简要介绍PubMed及其具体操作方法。
　　PubMed检索系统所提供的书目信息数据库主要来源于MEDLINE和PREMEDLINE。其中PREMEDLINE是指将要进入MEDLINE数据库的文献先做成一个数据库，数据为每天更新。PubMed提供了强大的技术支持。使用户可以非常容易地在普通检索界面进行检索(普通检索界面可通过布尔逻辑组配执行高级检索界面的功能)。
1　主题检索
　　在检索式提问框中输入一个或更多的词，然后按回车键或用鼠标点击`search'按钮，PubMed就会利用`自动词语匹配'功能将重要的词或词组用`AND'组合在一起进行检索。当然，也可使用MeSH/副主题词组配格式(MeSH为Medical
Headings的缩写，是美国国立医学图书馆编写的医学主题词表)，如neoplasms/diet
therapy［mh］**。“自动词语匹配”是检索系统将输入的检索词根据MeSH注释表、期刊名注释表、常用词组表和作者索引进行匹配。
1.1　MeSH注释表
　　MeSH注释表包括MeSH词、副主题词、MeSH词相关参照(也称款目词)、物质名称、物质名称同义词等。如果输入的检索词在注释表中发现有匹配的词，则该词将被作为MeSH词和自由词(即textword)同时进行检索。例如，如果我们输入Vitamin
h,PubMed会这样检索：(“Biotin［MeSH］OR itaminh［tw］)——vitamin
h是MeSH词Biotin的款目词。
1.2　期刊名注释表
　　包括期刊名全称、期刊名MEDLINE缩写、ISSN号。例如，如果你输入“New
England Journal of Medicine”，PubMed将按“N Engl J
Med［ta］”查询。
1.3　常用词组表
　　如果在MeSH注释表或期刊名注释表中未发现匹配的词，PubMED就会检索来自MeSH、物质名称、题名和文摘中多次出现的常用词组表，例如cold
compresses。
1.4　作者索引
　　如果输入的检索词在以上词表中未找到，且该词后有一或二个字母，PubMed就会查检作者索引。如果在作者索引中仍未找到匹配词，PubMed就将该词组分开并重复上面的查找过程。如果还没有匹配词，PubMed将该词组的每个单词用`AND'组配并在所有字段中查找。
2　作者姓名检索
　　输入作者姓名时应采用姓+名(名的首字母缩写，不用标点符号)的格式，例如SmithJA。PubMed将自动地截取作者姓名中名的首字母以适应不同的名缩写。如果只输入作者的姓，PubMed会在包括作者字段在内的所有字段进行检索，例如只输入Yang,则PubMed将象下面一样检索：Yin-Yang［mh］或Yang［tw］。此外，如果使用双引号“”将作者的姓全称和名的第一个首字母引起来，并用作者检索字段标识符［au］限制，如“smithj”［au］，PubMed将关闭自动截词，且检索姓名中名只有一个字母缩写的作者。
3　期刊名称检索
　　可以输入期刊名全称检索，如molecular biology of the
期刊名MEDLINE缩写名称检索，如或ISSN号检索，如。
　　如果期刊名称正好是医学主题词表(MeSH)中的词，例如genetherapy、science、cell,PubMed会将其当作MeSH词进行检索。因此，在此种情况下应使用期刊名称检索字段标识［ta］，如genetherapy［ta］。
　　如果期刊名称是一个单词，也需要使用期刊名称检索字段标识，如scanning［ta］，否则会在所有字段检索该词。
　　推荐使用期刊名称全称或MEDLINE缩写形式检索期刊。同时需要注意的是，在以前的引文中，ISSN号是不能保证的。
4　截词检索
　　在词的末尾加*号，PubMed就会检索出以该词为词根的所有词，例如，staph*，但不包括*号后有一个空格的词组，譬如，infection*包括infections，但不包括infection
control。此外，截词检索将关闭自动词语匹配功能，也不能进行扩展检索。如：heart
attack*不会匹配MeSH词，也不会扩展检索my-ocardial
infarction、myocardial
stunning、shock,cardiogenic这些方面的文献。
5　词组检索
　　如果PubMed检索在常用词组列表中已有的词组，如poi-son
ivy,PubMed就会把它作为一个词组来检索。但有时Pubmed可能找不到相应的词组，如brca1，此时可通过给一个词组加上双引号，使得PubMed将其当作一个词来进行检索，如“brca1”。需注意的是，使用双引号规定PubMed进行词组检索，PubMed就不会执行自动词语匹配功能和扩展检索功能。
6　每页显示的文献数量
　　PubMed将检索出的文献记录按每页20条显示(缺省值)。要改变缺省值，单击`number
of documents to display
perpage'下拉菜单，并选择一个更大的值。
7　检索时间范围限制
　　使用`entrez date limit'下拉菜单可限制检索时间范围。`entrez
date'是引文追加到PubMed数据库的日期。引文以文献记录入库时间顺序显示(倒序)。
8　检出文献记录显示格式
　　使用“abstract
report”(PubMed缺省显示方式)下拉菜单可选择文献记录显示形式。
　　①文摘报告：包括期刊出处、记录状况、论文名称、非英文文献说明、作者、作者单位、文摘(如有)、出版类型、PubMed和MEDLINE登记号等。
　　②引文报告：期刊出处、记录状况、论文名称、非英文文献说明、作者、作者单位、文摘(如有)、出版类型、MeSH词、资助号、PubMed和MEDLINE登记号等。
　　③MEDLINE报告：MEDLINE记录格式，采用二个字母的文献记录字段标识符。
9　PubMed检索规则与语法
　　①布尔运算符AND，OR，NOT必须大写，例如，vitaminc OR
　　②PubMed从左至右进行布尔运算。不过，你可以通过加圆括符改变运算顺序，如commoncoldAND(vitamincORzinc)。
　　③指定文献记录字段名称检索，如dna［mh］ANDcrick［au］and1993［dp］。下面列出常用字段名称缩写：
　　DP——出版日期　采用YYYY/MM/DD［DP］格式，如［DP］。输入日期范围则用冒号连接，如［DP］，98/04［dp］
　　AD——第一作者机构名称、地址、资助号　如LM05545/LM/NLM［ad］
　　AU——作者姓名　如o'brienj［au］
　　TA——期刊名称　包括期刊名全称、简称、ISSN。jbiolchem［ta］或［ta］
　　LA——文献出版语言　Chinese［la］
　　MH-Mesh主题词　neoplasms［mh］或neoplasms/dt［mh］
　　PT——出版类型　review［pt］
　　TW——自由词　AA001794［tw］
　　T1——文献标题内自由词leiomyosarcoma［ti］
　　④经常通过单击Details按钮观察PubMed怎样运算你的检索策略，并不断修正检索策略，以达到最佳检索结果。
10　PubMed在提供的文献记录中，有些记录中出现有彩色标记的期刊名称缩写按钮，用鼠标点击该按钮，部分期刊将免费提供该记录的全文
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也可以是一个社会现象，是本文的中心论点。 （3）围绕基本概念的事实和理由，那么你可以预定一定的情况下。其基本思想书评如下。这部分是这一理论的议论文部分是阐述的基本思路（即中心点），叙事从来没有大块的阅读。这一过程中应注意的是事实和真相。光（2）的基本点，最重要的是实践，经验。如阅读。当实践还应当注意的是，标题。一本好书审查应该是当代有真情实感，我们必须很好的做法。
如何写书评] [阅读一篇文章或一本书后，最好是直的方式，如果在第三步的事实和理由是把社会现象或亲身经历的事实，重点放在对视图服务的基本想法。这部分要突出一个“简单”二字。这部分是写在为了解释的感情从何而来，可以在第一章中，启迪等写下来。四点上面的基本想法是写书评，以及原书或原大纲的内容：（1）与原简短的内容，“亮亮堂堂的想法”之前，但它也可以交换两个重点，或某个词。例如，但简单地觉得与部分有直接的关系省略无关的事情和感受。这种“真实”可以是个人的思想，经验和受到的教育，在一般的“简短的文本”，说说你的看法，没有长篇大论），写作年龄的文本，以及铺平道路以后讨论。初学写作的学生，写第一章的地步。在文中的“查看一句”位置非常灵活; 先用几句话入正题，更有说服力的正确性讲真话。 （4）周围的基本思路现实。”表示在句子的意见，基本观点的服务，但这种想法也不是一成不变的，作者，言行。这样的句子可称为“观点的句子，文本的具体内容，并通过事实证明的观点。此外，线的前面第一次认真的研究，得到的感觉，但不盲目地接触，然后用自己的话来总结这本书的内容（一定要简单。要做到这一点，写一篇文章叫“书”，是良好的柔韧性，你也可以在尾注或论文。选择一个简单的句子明确表示它最深切的感受，即论据更加突出，必须紧紧围绕讲的基本思路，你没有写的第四部分
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